修復 Dicom 影像 Delimitation 錯誤

去年換工作前從之前的醫院那備份了不少教學用的 dicom 影像檔,想說可以拿來教學用,但不知是什麼原因,格式是錯的,不論是 OsiriX/Horos, dcmtk 通通無法正確 parse,無法 import 進 PACS,一直無法解決,但比較奇怪的是,有一些檔案還是正常的,殘餘可用的教學檔就這麼撐了一年多。

因為實在是受不了缺東缺西的影像,趁著最近有 upgrade Orthanc,再來試試看會不會新版 PACS 有做一些錯誤容許度的調整,但可惜的還是不行。

Dcmdump 出來的錯誤訊息是

看起來問題是出在 Item Delimitation Item (FFFE,E00D) 錯用成 Sequence Delimitation Item (FFFE,E0DD),而 dcmtk 有提供一個 option (+rd)

可以把錯的 delimiter 修掉, 所以用 dcmconv 把整批 dicom 檔全部轉完就可以正常 parse 和匯入 Orthanc 了。(撒花)

Google 資料的過程中發現有人反應過類似的問題,但它的錯誤訊息是

另外有趣的點是他們也是 GE 的機器出問題(前醫院用的也是 GE),不過我不覺得和 GE 有很大的關係就是了。前醫院用的是自架的 PACS,可能是 Dcm4chee,然後用的是自己開發的 dicom viewer,可能沒有在 validate, 或是跳過這一部份,或是曾經為了某種原因 hack 過用了 workaround,總之,從 dicom viewer export 出來的檔案大致上沒問題(但要我一份一份 export 效率實在太低不可行),而直接用 wado 從 PACS 上拉下來的檔案,或是 cache 在 viewer 裡的檔案(兩個來源應該相同)就是有問題的。

先前也提過這個很奇怪的狀況,不是全部檔案都有問題,但如果一組影像缺東缺西也是沒用(很多都是只有每個 series 的第一張是正確的),真不知道前醫院當初到底對 PACS 做了什麼。

大批教學檔匯入後,我中午的教學課程就有更多材料可用了,好感動啊!解決了一個困擾我一年多的問題,興奮到覺得昨天值班的疲勞都一掃而空了。


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